Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msr1P30204 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msr1P30204 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Msr1P30204 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms