Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
VtnP29788 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
VtnP29788 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VtnP29788 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VtnP29788 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VtnP29788 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VtnP29788 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
VtnP29788 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
VtnP29788 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
VtnP29788 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
VtnP29788 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VtnP29788 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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