Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RxraP28700 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RxraP28700 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RxraP28700 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RxraP28700 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RxraP28700 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RxraP28700 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RxraP28700 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RxraP28700 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms