Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Etv4P28322 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Etv4P28322 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms