Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa2P28309 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms