Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vav1P27870 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vav1P27870 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms