Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria2P23819 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gria2P23819 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria2P23819 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms