Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hoxd12P23812 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxd12P23812 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms