Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PparaP23204 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PparaP23204 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PparaP23204 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PparaP23204 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PparaP23204 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms