Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tap1P21958 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms