Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ms4a2P20490 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ms4a2P20490 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms