Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PdgfaP20033 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms