Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NefhP19246 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NefhP19246 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NefhP19246 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NefhP19246 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NefhP19246 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms