Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RargP18911 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RargP18911 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RargP18911 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RargP18911 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RargP18911 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms