Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rps6ka1P18653 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms