Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P18533 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P18533 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P18533 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
P18533 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18533 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18533 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18533 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18533 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18533 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18533 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
P18533 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms