Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defa-rs1P17533 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms