Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rag1P15919 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms