Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnmt1P13864 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnmt1P13864 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms