Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scd1P13516 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Scd1P13516 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms