Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nr4a1P12813 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nr4a1P12813 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms