Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timp1P12032 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp1P12032 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp1P12032 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Timp1P12032 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms