Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamp1P11438 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms