Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Schip1P0DPB4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Schip1P0DPB4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms