Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnmt3cP0DOY1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms