Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Amd1P0DMN7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Amd1P0DMN7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms