Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Col4a2P08122 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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