Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Spta1P08032 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spta1P08032 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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