Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2-Eb1P04230 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2-Eb1P04230 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms