Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

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Length 119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01808 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01808 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01808 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01808 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01808 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01808 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01808 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01808 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01808 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01808 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01808 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01808 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01808 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01808 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01808 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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