Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01679 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01679 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01679 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01679 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01679 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01679 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01679 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01679 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01679 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01679 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01679 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms