Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
P01657 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
P01657 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01657 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01657 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01657 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01657 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01657 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms