Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
CntfrO88507 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CntfrO88507 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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CntfrO88507 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
CntfrO88507 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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