Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
AurkcO88445 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199 ms