Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cfdp1O88271 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Cfdp1O88271 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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