Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd46O88174 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd46O88174 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms