Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mid1O70583 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mid1O70583 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms