Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb5O70309 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb5O70309 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb5O70309 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb5O70309 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb5O70309 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb5O70309 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb5O70309 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb5O70309 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Itgb5O70309 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Itgb5O70309 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms