Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Aff2O55112 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms