Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PrxO55103 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrxO55103 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrxO55103 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrxO55103 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PrxO55103 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PrxO55103 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrxO55103 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrxO55103 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrxO55103 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrxO55103 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PrxO55103 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrxO55103 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms