Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Syngr1O55100 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syngr1O55100 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms