Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb2O55029 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb2O55029 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb2O55029 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms