Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rnf13O54965 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
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Rnf13O54965 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf13O54965 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf13O54965 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf13O54965 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Rnf13O54965 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf13O54965 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf13O54965 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rnf13O54965 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Rnf13O54965 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf13O54965 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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