Protein–RNA interactions for Protein: O54864

Suv39h1, Histone-lysine N-methyltransferase SUV39H1, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suv39h1O54864 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h1O54864 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h1O54864 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h1O54864 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h1O54864 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h1O54864 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h1O54864 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h1O54864 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h1O54864 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h1O54864 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Suv39h1O54864 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Suv39h1O54864 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms