Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
DffbO54788 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
DffbO54788 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
DffbO54788 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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