Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek2O35942 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Nek2O35942 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nek2O35942 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms