Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TnxbO35452 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TnxbO35452 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TnxbO35452 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TnxbO35452 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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TnxbO35452 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms