Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Prrt1O35449 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Prrt1O35449 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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