Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Kpna3O35344 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Kpna3O35344 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms