Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sh2d1bO35324 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sh2d1bO35324 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Sh2d1bO35324 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d1bO35324 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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